Офтальмоферон применяют местно, закапывая в конъюнктивальный мешок поражённого глаза.

Режим дозирования зависит от стадии заболевания:

Острые вирусные инфекции: 1-2 капли до 6-8 раз в сутки, затем по мере улучшения частоту снижают до 2-3 раз в сутки.
Синдром сухого глаза: 1-2 капли 2 раза в день в течение 25-30 дней.
Профилактика послеоперационных осложнений: 1-2 капли 2 раза в день за 2 дня до операции и 10-14 дней после неё.