Расхождения произношения гласных и согласных звуков в русском языке встречаются в следующих случаях:

Аккомодация (влияние соседних звуков):

Гласные изменяются под влиянием согласных. Например, в слове “пять” звук [а] становится более “передним” из-за мягкости согласного [т’].
Согласные могут менять свое звучание под влиянием гласных, например, в слове “съесть” согласный [с] произносится мягче из-за последующего гласного [е].
Редукция гласных:

В безударных слогах гласные произносятся не так, как в ударных. Например, в слове “молоко” гласный [о] в первом и втором слоге редуцируется до [ə]: [мəлəˈко].
Ассимиляция согласных:

Произношение согласных может меняться под влиянием соседних звуков. Например, в слове “сказка” звук [з] превращается в [с] под влиянием [к]: [ˈсказка].
Элизия (выпадение звуков):

Иногда звуки “выпадают” в произношении. Например, в слове “сердце” часто не произносится звук [д]: [ˈс’ерт͡сə].
Добавление звуков:

При соединении слов иногда появляются дополнительные звуки. Например, в фразе “я иду” может возникать лёгкий звук [й]: [йа иˈду].
Эти явления делают устную речь более естественной и плавной, однако могут создавать сложности для изучающих язык.